上海交通大学电气工程系源于1908年创设的交通大学（时为邮传部上海高等实业学堂）电机专科， 是中国近代科学技术史上最早建立的电气工程学科，从而开创了我国电气工程高等教育先河，成为我国电工学术策源地和电机工程师摇篮。

2001年经学校大电类学科调整，电气工程系与其他相关系所共同组建上海交通大学电子信息与电气工程学院，并发展至今。

电气工程系现负责上海交通大学“电气工程”一级学科的建设。学科现为上海市重点学科（1996年批准），并设有电气工程一级学科博士后流动站（1999年批准），并于2005年评为全国优秀博士后流动站（同学科中第1名）。电气工程学科下设电力系统及其自动化、电力电子与电力传动、高电压与绝缘技术、电机与电器、电工理论及其新技术五个二级学科，均具有博士及硕士学位授予权。其中“电力系统及其自动化”二级学科，现为国家重点（培育）学科。

近年来，电气工程系以国家能源互联网发展战略为抓手，积极促进不同学科、不同研究方向的有机融合以及技术转化，大力开拓全新学科生长点。通过一系列改革和建设，电气工程系各项科教指标显著上升，实现了跨越式发展，整体实力显著增强，为建设世界一流电气学科奠定了坚实基础。2018年，“电气工程”一级学科成功进入教育部首批“双一流”建设学科之列。

电气工程系师资力量雄厚，现有各类教职工百余人，其中教授/研究员30余名、副教授/副研究员60余名。师资队伍现有：中国工程院院士1人、顾毓琇电机工程奖获得者1人、国家级高层次人才计划6人、国家优青3人、青年长江3人、青年拔尖2人、海外优青3人、教育部新世纪人才计划获得者3人、上海市优秀学术带头人5人、上海市浦江人才计划6人、上海市青年扬帆计划9人。

电气工程系始终把培养具有全球视野和国际竞争力的创新型人才作为办学根本任务。